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作者

任倩 张乐海 马丽霞 王世富 吕欣 张忠 于爱莲

作者单位

山东大学齐鲁儿童医院 泰山医学院病原生物学教研室

刊名

中国病原生物学杂志

年份

2011

卷号

第6卷

期号

第8期

页码

561-564，570

ISSN

1673-5234

关键词

手足口病 柯萨奇病毒A10型 柯萨奇病毒A6型 VP1区域 基因序列分析

分类号

R373.23

摘要

目的鉴定手足口病患儿咽拭子病原体柯萨奇病毒A10（CVA10）和A6（CVA6）,并对其VP1编码区3′端序列进行分析。方法合成对肠道病毒VP1区3′端序列具有较高特异性的兼并引物040-011,RT-PCR方法测定其VP1区3′端基因序列,通过BLAST程序比对,鉴定病毒的基因型;与GenBank中其他已知病毒基因型序列进行同源性分析,构建遗传进化树。结果 38例非EV71非CVA16引起的手足口病患儿咽拭子,5例检测到CVA10,1例检测到CVA6。在进化关系上CVA10与D基因型最为密切,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.7%94.2%、91.7%100%;CVA6与20032009年报告的部分毒株核苷酸同源性为86.8%90.2%,其中与2008年台湾EU908148的毒株同源性最高;氨基酸同源性为85.2%89.0%。结论兼并引物040-011对CVA10和CVA6有良好的基因扩增特异性;引起手足口病的肠道病毒除EV71和CVA16外,CVA10和CVA6也是重要的病原;鉴于2008年芬兰和2009年山东省文登市CVA10引起的手足口病暴发,应加强对手足口病病原的检测和分型,以...更多

目的鉴定手足口病患儿咽拭子病原体柯萨奇病毒A10（CVA10）和A6（CVA6）,并对其VP1编码区3′端序列进行分析。方法合成对肠道病毒VP1区3′端序列具有较高特异性的兼并引物040-011,RT-PCR方法测定其VP1区3′端基因序列,通过BLAST程序比对,鉴定病毒的基因型;与GenBank中其他已知病毒基因型序列进行同源性分析,构建遗传进化树。结果 38例非EV71非CVA16引起的手足口病患儿咽拭子,5例检测到CVA10,1例检测到CVA6。在进化关系上CVA10与D基因型最为密切,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.7%94.2%、91.7%100%;CVA6与20032009年报告的部分毒株核苷酸同源性为86.8%90.2%,其中与2008年台湾EU908148的毒株同源性最高;氨基酸同源性为85.2%89.0%。结论兼并引物040-011对CVA10和CVA6有良好的基因扩增特异性;引起手足口病的肠道病毒除EV71和CVA16外,CVA10和CVA6也是重要的病原;鉴于2008年芬兰和2009年山东省文登市CVA10引起的手足口病暴发,应加强对手足口病病原的检测和分型,以了解柯萨奇病毒在手足口病中的位置,掌握其遗传进化特征。收起

学科

【教育部学科】医学

文献类型

期刊

浏览量

31