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作者

许美玲 吴雪嵩 朱凯 李金栋 王倩 纪龙

作者单位

泰安市泰山区疾病预防控制中心 泰山医学院公共卫生学院

刊名

泰山医学院学报

年份

2016

卷号

第37卷

期号

第9期

页码

961-967

ISSN

1004-7115

关键词

室间隔缺损 微小RNA NOTCH1 HAND1 ZFPM2 GATA3

分类号

R725.4

摘要

目的先天性心脏病(CHD)是环境因素和遗传因素共同作用的结果。室间隔缺损(VSD)是CHD中最常见的一种。研究表明,microRNAs(miRNAs)与CHD的发生发展关系密切,但目前缺乏有关miRNAs与VSD的研究报道。本研究旨在通过血清差异miRNA的表达研究阐明miRNA与VSD发生发展的关系。方法采用miRNA表达谱芯片技术进行VSD患者血清miRNA表达差异分析,并对结果进行实时定量PCR(Real-time PCR)验证,进而对miRNA调控的靶基因进行生物信息学分析。结果通过miRNA芯片在VSD患者和对照血清样本中检测miRNA差异表达,筛选出36个表达差异的miRNA(P<0.05),其中21个miRNA在VSD患者表达显著下调,15个表达显著上调。经过Real-time PCR验证,证实8个miRNAs差异表达有意义。通过生物信息学预测出447个靶基因,经GO分析富集度分值(enrichment score value)最大的生物过程(biological process)为心脏右心室形态发生(cardiac right ventricle morphoge...更多

目的先天性心脏病(CHD)是环境因素和遗传因素共同作用的结果。室间隔缺损(VSD)是CHD中最常见的一种。研究表明,microRNAs(miRNAs)与CHD的发生发展关系密切,但目前缺乏有关miRNAs与VSD的研究报道。本研究旨在通过血清差异miRNA的表达研究阐明miRNA与VSD发生发展的关系。方法采用miRNA表达谱芯片技术进行VSD患者血清miRNA表达差异分析,并对结果进行实时定量PCR(Real-time PCR)验证,进而对miRNA调控的靶基因进行生物信息学分析。结果通过miRNA芯片在VSD患者和对照血清样本中检测miRNA差异表达,筛选出36个表达差异的miRNA(P<0.05),其中21个miRNA在VSD患者表达显著下调,15个表达显著上调。经过Real-time PCR验证,证实8个miRNAs差异表达有意义。通过生物信息学预测出447个靶基因,经GO分析富集度分值(enrichment score value)最大的生物过程(biological process)为心脏右心室形态发生(cardiac right ventricle morphogenesis),对应的差异表达基因为NOTCH1、HAND1、ZFPM2和GATA3,调控这些基因的miRNA可能包括hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p和hsa-miR-433。结论通过微阵列技术分析和RT-PCR验证,筛选出8个差异表达miRNA,为后续实验提供了可供分析的miRNA。利用3个数据库及GO分析,发现hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p和hsa-miR-433的靶基因分别为NOTCH1、HAND1、ZFPM2和GATA3,为进一步在基因水平研究VSD的发病机制提供了新的突破口,为将来可能实现的基因诊断、基因干预治疗以及疾病的预防奠定了一定的实验基础。收起

基金

山东省医药卫生科技发展计划项目

学科

【教育部学科】医学

文献类型

期刊

浏览量

51