专家学者_山东第一医科大学机构知识库
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引起某禽类养殖场疫情的H3N2亚型流感病毒全基因组进化分析
作者
徐春雪 刘伟 焦伯延 王震 刘倜 孙林 张钦凤 王显军
作者单位
济宁市兖州区疾病预防控制中心 泰山医学院 济宁市疾病预防控制中心 山东省疾病预防控制中心山东大学预防医学研究院山东省传染病重点实验室
刊名
中华实验和临床病毒学杂志
年份
2018
卷号
第4期
页码
367-372
ISSN
1003-9279
关键词
甲型流感 暴发 基因序列 抗原分析
分类号
R511.7
摘要
目的了解某禽类养殖场工人间的1起流感样病例暴发疫情的流行病学特点,确定疫情性质,分析流感病毒是否存在变异或基因重组,试阐述流感病毒来源。方法采用个案调查等流行病学调查方法开展现场调查,采集所有流感样病例咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离;对分离到的病毒进行全基因组测序,运用EditSeq和MEGA5.05软件进行序列比对和进化分析。 结果此次暴发疫情共报告流感样病例15例,罹患率为34.88%,核酸检测阳性率73.33%,分离到季节性A(H3N2)型流感病毒5株。进化分析显示分离到的H3N2流感病毒的8个基因片段均与2015—2016年流感疫苗株处于同一分支上,没有发生与禽或猪流感病毒的基因重组。5株流感病毒的血凝素(HA)有14个氨基酸位点发生了替换,其中8个位于抗原决定簇上;对神经氨酸酶基因和基质蛋白基因进行氨基酸推测分析显示,所有流感病毒均对神经氨酸酶抑制剂药物敏感,对M2离子通道抑制剂药物耐药。糖基化位点分析显示,NA新增两个糖基化位点NRT151-153、NAT245-247,其余基因未变。结论此次暴发疫情为一起季节性A(H3N2)型流感病毒暴发,病毒发生了抗原漂移,未发现与...更多
基金
国家科技重大专项;山东省医药卫生科技发展计划项目
文献类型
期刊
浏览量
28
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