专家学者_山东第一医科大学机构知识库
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生物信息学分析导致类风湿关节炎性别差异的关键基因与信号通路
作者
苏思维 姜雯君 王晓颖 杜森 宋洪强
作者单位
山东第一医科大学暨山东省医学科学院运动医学研究所
刊名
中国免疫学杂志
年份
2022
卷号
第38卷
期号
第21期
页码
2628-2633
ISSN
1000-484X
关键词
类风湿关节炎 差异表达基因 蛋白质-蛋白质相互作用网络 性别差异
分类号
R593.22;Q811.4
摘要
目的:通过生物信息技术分析探讨类风湿关节炎发病机制中性别间生物学差异的关键基因和通路。方法:从GEO数据库中获取GSE55457、GSE55584、GSE12021中正常男女性滑膜样本和RA男女性患者滑膜样本的基因表达数据,将数据整合并使用R软件对差异表达基因进行鉴定。使用在线工具DAVID数据库对DEGs进行GO分析和KEGG分析。使用Cytoscape 3.6.0构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行模块分析。结果:男性组高表达基因416个,低表达基因336个,女性组高表达基因744个,低表达基因309个。在男性RA发病中,IL-6、MYC、EGFR、FOS和JUN被认为是关键基因;在女性RA发病中,IL-6、ALB、PTPRC、CXCL8和CCR5被认为是关键基因。结论:生物信息学分析筛选出的差异基因分别参与男性和女性RA疾病进展的不同机制,为RA发病机制的探究提供了理论依据。
基金
山东省高等学校科技计划项目;山东省自然科学基金
文献类型
期刊
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