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作者

苏慧超 张臻 唐晓慧 于金明

作者单位

天津医科大学肿瘤医院国家恶性肿瘤临床医学研究中心天津市恶性肿瘤临床医学研究中心天津市肿瘤防治重点实验室 山东第一医科大学附属肿瘤医院临床研究部 荷兰马斯特里赫特大学放射肿瘤学系放射肿瘤科

刊名

国际医药卫生导报

年份

2023

卷号

第1期

ISSN

1007-1245

关键词

宫颈癌 免疫微环境 免疫治疗 预后评价

摘要

目的 探究宫颈癌中免疫相关长链非编码RNA模型与患者预后及免疫治疗应答的关系。方法 在癌症基因组图谱数据库中获取255例宫颈癌患者的转录组测序数据及相应的临床信息，通过生物信息学方法提取免疫相关lncRNA，使用Kaplan-Meier分析和多因素COX回归分析构建预测模型。受试者工作特征曲线用于评估预测模型的效能。以模型评分的中位值将患者分为高低风险两组。使用CIBERSORT、单样本基因富集分析等算法评估不同分组间免疫浸润的差异，使用基因本体富集分析、基因集合富集分析、基因集合变异分析分析探究模型与免疫通路的联系。同时使用肿瘤免疫功能障碍与排斥评分及免疫表观评分探索不同分组间免疫治疗应答的差异。结果 通过Kaplan-Meier分析和多因素COX回归分析构建了免疫相关lncRNA预测模型，生存曲线显示出两组患者预后的差异有统计学意义，预测模型的1、2、3年ROC曲线下面积分别为0.850、0.796、0.702。低风险组的免疫得分显著高于高风险组。基于反卷积的免疫算法CIBERSORT结果提示CD8T细胞、辅助T细胞、B细胞和M0、M1型巨噬细胞在两组间差异均有统计学意义。低风...更多

目的 探究宫颈癌中免疫相关长链非编码RNA模型与患者预后及免疫治疗应答的关系。方法 在癌症基因组图谱数据库中获取255例宫颈癌患者的转录组测序数据及相应的临床信息，通过生物信息学方法提取免疫相关lncRNA，使用Kaplan-Meier分析和多因素COX回归分析构建预测模型。受试者工作特征曲线用于评估预测模型的效能。以模型评分的中位值将患者分为高低风险两组。使用CIBERSORT、单样本基因富集分析等算法评估不同分组间免疫浸润的差异，使用基因本体富集分析、基因集合富集分析、基因集合变异分析分析探究模型与免疫通路的联系。同时使用肿瘤免疫功能障碍与排斥评分及免疫表观评分探索不同分组间免疫治疗应答的差异。结果 通过Kaplan-Meier分析和多因素COX回归分析构建了免疫相关lncRNA预测模型，生存曲线显示出两组患者预后的差异有统计学意义，预测模型的1、2、3年ROC曲线下面积分别为0.850、0.796、0.702。低风险组的免疫得分显著高于高风险组。基于反卷积的免疫算法CIBERSORT结果提示CD8T细胞、辅助T细胞、B细胞和M0、M1型巨噬细胞在两组间差异均有统计学意义。低风险组中免疫通路被显著富集。TIDE和IPS评分在不同风险组间差异均有统计学意义。结论 宫颈癌免疫相关lncRNA模型可作为生物标志物用来预测宫颈癌患者接受免疫治疗的应答率及预后。收起

基金

天津市自然科学基金

文献类型

期刊

浏览量

18