铁死亡相关基因DPP4与肿瘤免疫及预后的生物信息学研究
- 作者单位
- 山东第一医科大学,山东省医学科学院临床与基础医学院
- 刊名
- 中国免疫学杂志
- 年份
- 2023
- 卷号
- 第11期
- ISSN
- 1000-484X
- 摘要
- 目的:分析铁死亡相关基因DPP4在泛癌中的表达及其在肿瘤免疫、预后等方面的作用,探讨DPP4在肿瘤免疫治疗及临床预后中的价值。方法:利用CCLE、TCGA 及GTEx 数据库对铁死亡相关基因DPP4 进行泛癌的差异表达分析,并通过Kaplan-Meier及Cox 回归分析DPP4与肿瘤预后的相关性;使用CIBERSORT 算法评估TIMER 数据库中肿瘤免疫细胞浸润情况,ESTIMATE 算法评估肿瘤微环境,Spearman 检验分析基因表达与免疫新抗原、肿瘤突变负荷及微卫星不稳定性的关联;GSEA软件研究DPP4在肿瘤中的表达与信号通路的相关性。结合人类蛋白质图谱数据库、TCGA数据库及GEO数据库对分析结果进行验证。结果:DPP4 基因在多种肿瘤中的表达差异具有统计学意义,且与多种肿瘤的生存及预后密切相关,其中在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、胸腺癌中可作为保护因素,对肿瘤预后有正向作用;DPP4与肿瘤的多种免疫细胞浸润及免疫微环境密切相关,最显著相关的3类肿瘤为膀胱尿路上皮癌、乳腺浸润癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤;DPP4与免疫新抗原、肿瘤突变负荷与微卫星不稳定性显著相关;GSEA分析结果...更多
- 文献类型
- 期刊
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