基于网络药理学及分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎机制的研究
- 获取途径
- 作者
-
王恺
王琳
于勇
张汝敏
侯念宗
- 作者单位
-
山东第一医科大学附属淄博市中心医院转化医学中心
山东第一医科大学附属淄博市中心医院重症医学科
- 刊名
- 中国中西医结合急救杂志
- 年份
- 2023
- 卷号
- 第30卷
- 期号
- 第5期
- 页码
- 568-575
- ISSN
- 1008-9691
- 关键词
-
小承气汤
急性胰腺炎
网络药理学
分子对接
机制
- 摘要
- 目的 应用网络药理学与分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎的作用机制.方法 于中药药理学分析平台数据库筛选大黄、枳实、厚朴的活性成分,应用瑞士目标预测数据库预测相关靶点.通过药物银行数据库、基因卡片数据库、人类孟德尔遗传在线数据库、治疗靶点数据库及药物基因组学知识库数据库中筛选出AP的相关靶点.运用String数据库构建靶点蛋白互作网络,采用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析,使用R3.6.2 软件对相关靶点进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书通路注释分析,通过Autodock 4.2.6软件以及Vina软件进行分子对接.结果 共筛选出小承气汤与AP直接相关的交集靶点 124 个,通过网络拓扑分析发现 11 个靶点,包括视网膜母细胞瘤 1基因、蛋白激酶B基因、细胞周期蛋白D1基因、禽髓细胞瘤病毒癌基因同源物基因、雌激素受体 1基因、网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A基因、激活蛋白 1基因、p53 基因、丝裂素活化蛋白激酶基因为核心靶点.GO富集分析及KEGG通路富集分析显示,小承气汤可通过干预细胞凋亡、调节胰腺细胞增殖分化、抑制氧化应激等方面治疗AP,其中磷脂酰肌...更多
- 目的 应用网络药理学与分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎的作用机制.方法 于中药药理学分析平台数据库筛选大黄、枳实、厚朴的活性成分,应用瑞士目标预测数据库预测相关靶点.通过药物银行数据库、基因卡片数据库、人类孟德尔遗传在线数据库、治疗靶点数据库及药物基因组学知识库数据库中筛选出AP的相关靶点.运用String数据库构建靶点蛋白互作网络,采用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析,使用R3.6.2 软件对相关靶点进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书通路注释分析,通过Autodock 4.2.6软件以及Vina软件进行分子对接.结果 共筛选出小承气汤与AP直接相关的交集靶点 124 个,通过网络拓扑分析发现 11 个靶点,包括视网膜母细胞瘤 1基因、蛋白激酶B基因、细胞周期蛋白D1基因、禽髓细胞瘤病毒癌基因同源物基因、雌激素受体 1基因、网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A基因、激活蛋白 1基因、p53 基因、丝裂素活化蛋白激酶基因为核心靶点.GO富集分析及KEGG通路富集分析显示,小承气汤可通过干预细胞凋亡、调节胰腺细胞增殖分化、抑制氧化应激等方面治疗AP,其中磷脂酰肌醇 3-激酶/蛋白激酶B信号通路是最重要的通路.选取小承气汤关键活性成分与核心基因靶点进行分子对接,结果表明,柚皮素分别与PKB、MAPK1、MAPK3;川陈皮素分别与AP-1、p53 基因;木犀草素分别与CCND1、RB1 RELA;木犀草素四甲醚与MAPK14;芦荟大黄素与MYC;儿茶素与ESR1 等 11 对成分-靶点对接的自由能较小,显示出良好的对接活性.结论 通过网络药理及分子对接的方法证实小承气汤治疗AP具有多途径、多靶点作用的特点,并揭示了相关物质基础和作用机制,这为经典名方在临床的广泛应用提供了参考,也为后期的基础研究提供了理论依据收起
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- 期刊
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