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作者

刘建东 韩翠云 钟敬涛 徐慧荣

作者单位

山东大学齐鲁医院急诊科 山东第一医科大学第一附属医院(山东省千佛山医院)护理部 山东省肿瘤防治研究院(山东省肿瘤医院)介入三病区

刊名

青岛大学学报(医学版)

年份

2023

卷号

第6期

ISSN

2096-5532

关键词

癌,肝细胞 RNA,长链非编码 微RNAs 细胞周期蛋白依赖激酶4 预后 计算生物学

摘要

目的 探讨长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因17在肝细胞癌发生发展中的作用。方法 利用基因表达谱交互分析数据库,分析HCC中SNHG17的表达及其与生存的关系;利用基因表达综合数据库的数据进行验证,使用GEO2R、lnCAR和Metascape软件分析SNHG17相关性基因、构建可视化网络并进行GO和KEGG富集分析。根据通路利用多个GEO数据集筛选出细胞周期蛋白依赖性激酶4;利用数据库平台StarBase、miRBD以及HMDD筛选出同时以SNHG17和CDK4为靶基因的microRNA。结果 lncRNA SNHG17在HCC中的表达显著上升,其表达高的病人预后显著变差。GO和KEGG富集分析结果显示,SNHG17与核蛋白复合物以及细胞周期相关。筛选出高度相关基因CDK4并筛选出以SNHG17和CDK4为靶标的miRNAs。结论 SNHG17在HCC中表达增高,并可通过结合多种miRNA发挥竞争性内源RNA的功能,对CDK4发挥调控作用。

基金

国家自然科学基金

文献类型

期刊

浏览量

14