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作者

石硕川 曾荣 张锦涛 张东 潘云 刘晓菲 许长娟 王莹 董亮

作者单位

²山东大学山东省千佛山医院呼吸与危重症医学科 ¹山东第一医科大学第一附属医院呼吸与危重症医学科山东省呼吸疾病研究所

刊名

山东大学学报(医学版)

年份

2024

卷号

第62卷

期号

第5期

页码

43-53

ISSN

1671-7554

关键词

支气管哮喘 免疫基因 生物标志物 免疫浸润

分类号

R562.25

摘要

目的 识别支气管哮喘发生发展过程中差异表达的免疫关键基因和免疫细胞，并探讨两者之间的相关性。方法 从公共基因表达数据库和Import数据库中分别下载哮喘相关数据集和免疫相关基因，利用R软件分析获得GSE76262中差异表达的免疫相关基因。在STRING数据库中明确DE-IRGs间的相互作用。使用Cytoscape软件中的CytoHubba插件筛选关键的DE-IRGs,并在GSE137268中进行验证。利用受试者工作特征曲线评估关键DE-IRGs作为生物标志物的潜力。此外，单样本基因集富集分析算法被用来分析28种免疫细胞在哮喘和健康者中的表达差别，使用斯皮尔曼相关系数评估关键免疫基因与免疫细胞之间的相关性。结果 在GSE76262中鉴定出17个DE-IRGs,经PPI网络的筛选和在GSE137268中的验证，CCL22、CCR7、IL1R2、IL18R1、TNFAIP3和VEGFA被识别为哮喘患者诱导痰中的关键DE-IRGs且具有较高的诊断价值。此外，ssGSEA的结果提示哮喘患者存在明显的免疫失衡，与健康者相比，11种免疫细胞在哮喘患者诱导痰中的浸润明显增加。同时，CCL22、CCR7...更多

目的 识别支气管哮喘发生发展过程中差异表达的免疫关键基因和免疫细胞，并探讨两者之间的相关性。方法 从公共基因表达数据库和Import数据库中分别下载哮喘相关数据集和免疫相关基因，利用R软件分析获得GSE76262中差异表达的免疫相关基因。在STRING数据库中明确DE-IRGs间的相互作用。使用Cytoscape软件中的CytoHubba插件筛选关键的DE-IRGs,并在GSE137268中进行验证。利用受试者工作特征曲线评估关键DE-IRGs作为生物标志物的潜力。此外，单样本基因集富集分析算法被用来分析28种免疫细胞在哮喘和健康者中的表达差别，使用斯皮尔曼相关系数评估关键免疫基因与免疫细胞之间的相关性。结果 在GSE76262中鉴定出17个DE-IRGs,经PPI网络的筛选和在GSE137268中的验证，CCL22、CCR7、IL1R2、IL18R1、TNFAIP3和VEGFA被识别为哮喘患者诱导痰中的关键DE-IRGs且具有较高的诊断价值。此外，ssGSEA的结果提示哮喘患者存在明显的免疫失衡，与健康者相比，11种免疫细胞在哮喘患者诱导痰中的浸润明显增加。同时，CCL22、CCR7、IL1R2、IL18R1、VEGFA、TNFAIP3与浸润的免疫细胞呈显著正相关。结论 CCL22、CCR7、IL1R2、IL18R1、VEGFA、TNFAIP3可作为哮喘的潜在生物标志物，且可能参与调控其发病过程中免疫细胞的浸润。收起

基金

国家自然科学基金;山东省自然科学基金

文献类型

期刊

浏览量

9