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作者

宋泽龙 吉旭彬 孙金川 曲玉婷 高萌 孙祥耀 王翔宇

作者单位

东营市人民医院创伤骨科 滨州市人民医院骨科 北京中医药大学第三附属医院 中国人民解放军总医院第一医学中心疼痛科 山东第一医科大学附属山东省立医院 首都医科大学附属宣武医院骨科 运城涑水创伤医院外科 南开大学医学院

刊名

滨州医学院学报

年份

2024

卷号

第3期

ISSN

1001-9510

关键词

玉屏风散 创口愈合 网络药理学 分子对接 常春藤皂苷元

摘要

目的 通过网络药理学及分子对接对玉屏风散药物成分、作用靶点进行数据挖掘、分析,以探究玉屏风散促进创口愈合的作用机制。方法 TCMSP检索玉屏风散有效成分、相关靶点,使用GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、DrugBank数据库检索疾病相关靶点,使用Perl语言进行归类数据分析。R语言绘制Venn图。STRING网络平台检索靶蛋白之间相互关系,并导出PPI网络图,使用Cytoscape软件将药物有效成分及疾病相关靶点网络关系可视化。使用Bioconductor数据、R语言进行数据分析并绘制相关柱状图、气泡图、通路图。使用PubChem数据库、 PDB数据库受体、配体信息,通过AutoDockTools进行分子对接、打分。结果 筛选出玉屏风散中有黄芪14种,防风16种,白术3种有效成分。PPI中筛选出18个核心靶点。GO及KEGG分析,AGE-RAGE通路、TNF 通路、EGFR通路、PI3K-Akt 通路、MAPK 通路、HIF-1 通路与玉屏风散促进创面愈合相关。玉屏风散有多种有效成分作用于核心靶点PPARγ,预测有效成分常春藤皂苷元可能作用于PPARγ靶点。结论 ...更多

目的 通过网络药理学及分子对接对玉屏风散药物成分、作用靶点进行数据挖掘、分析,以探究玉屏风散促进创口愈合的作用机制。方法 TCMSP检索玉屏风散有效成分、相关靶点,使用GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、DrugBank数据库检索疾病相关靶点,使用Perl语言进行归类数据分析。R语言绘制Venn图。STRING网络平台检索靶蛋白之间相互关系,并导出PPI网络图,使用Cytoscape软件将药物有效成分及疾病相关靶点网络关系可视化。使用Bioconductor数据、R语言进行数据分析并绘制相关柱状图、气泡图、通路图。使用PubChem数据库、 PDB数据库受体、配体信息,通过AutoDockTools进行分子对接、打分。结果 筛选出玉屏风散中有黄芪14种,防风16种,白术3种有效成分。PPI中筛选出18个核心靶点。GO及KEGG分析,AGE-RAGE通路、TNF 通路、EGFR通路、PI3K-Akt 通路、MAPK 通路、HIF-1 通路与玉屏风散促进创面愈合相关。玉屏风散有多种有效成分作用于核心靶点PPARγ,预测有效成分常春藤皂苷元可能作用于PPARγ靶点。结论 玉屏风散通过多靶点、多途径和多重机制促进创口愈合。常春藤皂苷元可能是作用于PPARγ靶点促进创面愈合的新机制。收起

文献类型

期刊

浏览量

29