基于生物信息学构建免疫相关基因口腔鳞状细胞癌预后模型及免疫浸润分析
- 作者单位
- 3山东第一医科大学第一附属医院口腔科 2济南市第五人民医院口腔科 1山东大学第二医院口腔医学中心
- 刊名
- 中华肿瘤防治杂志
- 年份
- 2025
- 卷号
- 第32卷
- 期号
- 第6期
- 页码
- 334-345
- ISSN
- 1673-5269
- 分类号
- R739.8
- 摘要
- 目的 构建与口腔鳞状细胞癌预后相关的免疫基因风险回归模型,并分析其与免疫浸润特征及转录因子调控网络的关系,以评估患者的预后情况。方法 从ImmPort数据库获取2 498个免疫基因数据,从Cistrome Cancer数据库获取318个转录因子数据,并从癌症基因组图谱数据库下载OSCC的mRNA表达数据及相应的临床信息。通过R 4.2.2进行数据分析,筛选出OSCC中差异表达的免疫基因和转录因子,并使用单因素和多因素Cox回归分析及LASSO回归分析筛选出与预后相关的免疫基因,进而建立预后相关免疫基因风险回归模型。同时,应用Cytoscape 3.7.1构建转录因子-免疫基因调控网络,并分析该模型与免疫细胞浸润丰度之间的关系。结果 共筛选出313个差异表达的免疫基因,并从中选出10个用于构建OSCC风险评估模型的免疫基因,包括肽聚糖识别蛋白4、趋化因子配体26、跨膜蛋白信号素3A、胃泌素、白细胞介素33、分泌型Ly6/PLAUR结构域含蛋白1、斯坦尼钙蛋白1、精...
- 文献类型
- 期刊