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作者

窦涛 窦乃馨 汪如 杨芊 管庆波 王磊 于春晓

作者单位

²山东第一医科大学附属中心医院胃肠外科 ¹内分泌糖脂代谢与脑老化教育部重点实验室,山东第一医科大学附属省立医院内分泌代谢病科,山东省内分泌与脂代谢重点实验室

刊名

山东大学耳鼻喉眼学报

年份

2025

卷号

第39卷

期号

第4期

页码

151-160，167

ISSN

1673-3770

关键词

甲状腺功能减退 高脂饮食 miRNA-mRNA网络

分类号

R581

摘要

目的 通过生物信息学方法分析参与高脂饮食损伤甲状腺功能的miRNA-mRNA调控网络，为早期干预脂毒性损伤甲状腺功能提供新的靶点。方法 给予大鼠高脂饮食8周，建立甲状腺功能损伤大鼠模型，以正常饮食组为对照，Agilent芯片检测甲状腺miRNA和mRNA表达，RStudio的limma包筛选差异miRNA和mRNA。miRwalk预测差异miRNA调控的潜在下游靶基因，利用微生信网站将预测的靶基因和差异mRNA取交集，建立差异miRNA-差异mRNA网络。通过在线网站Metascape对交集mRNA进行基因本体论注释和京都基因和基因组百科全书通路分析。利用String在线网站进行蛋白质-蛋白质相互作用分析，使用Cytoscape可视化PPI网络，CytoNCA插件筛选枢纽基因。基于关键基因建立高脂饮食损伤甲状腺功能的潜在miRNA-mRNA网络。

文献类型

期刊

浏览量

3