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作者

刘文娟 张可心 程鹏 张心雨 张倩 张忠 张瑞玲

作者单位

山东第一医科大学寄生虫病防治研究所 山东第一医科大学基础医学院

刊名

中国媒介生物学及控制杂志

年份

2022

卷号

第33卷

期号

第2期

页码

191-200

ISSN

1003-8280

关键词

白纹伊蚊 性别分化 miRNA-mRNA 调控网络分析

分类号

R384.1

摘要

目的 研究雌、雄白纹伊蚊中差异表达的miRNA及其相对应的mRNA靶基因，进而探讨雌、雄白纹伊蚊miRNA-mRNA间的调控关系、预测关键基因的潜在功能，为阐明白纹伊蚊性别分化的调控机制积累资料。方法通过构建雌、雄白纹伊蚊miRNA文库和mRNA测序分析，分别得到雌、雄白纹伊蚊差异表达miRNA和mRNA信息，采用生物信息学方法预测差异表达miRNA的靶基因，将预测得到的miRNA的靶基因与雌、雄样品间差异表达mRNA进行重叠筛选，然后构建miRNA-mRNA互作关系网络图。进一步对miRNA对应的靶基因进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书功能富集分析，了解miRNA可能的功能。结果 筛选到74个雌、雄差异表达miRNA，其中包含8个性别特异性miRNA。分别获得雌性特异表达的miRNA-mRNA 470对和雄性特异表达的miRNA-mRNA 481对。通过互作网络和功能富集分析，检测到4个与雌、雄白纹伊蚊性别分化及生殖功能相关的mRNA，以及直接参与调控它们的17个miRNA。结论 构建了雌、雄白纹伊蚊样品中差异表达的miRNA-mRNA互作网络，筛选获得性别相关的17个miRN...更多

目的 研究雌、雄白纹伊蚊中差异表达的miRNA及其相对应的mRNA靶基因，进而探讨雌、雄白纹伊蚊miRNA-mRNA间的调控关系、预测关键基因的潜在功能，为阐明白纹伊蚊性别分化的调控机制积累资料。方法通过构建雌、雄白纹伊蚊miRNA文库和mRNA测序分析，分别得到雌、雄白纹伊蚊差异表达miRNA和mRNA信息，采用生物信息学方法预测差异表达miRNA的靶基因，将预测得到的miRNA的靶基因与雌、雄样品间差异表达mRNA进行重叠筛选，然后构建miRNA-mRNA互作关系网络图。进一步对miRNA对应的靶基因进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书功能富集分析，了解miRNA可能的功能。结果 筛选到74个雌、雄差异表达miRNA，其中包含8个性别特异性miRNA。分别获得雌性特异表达的miRNA-mRNA 470对和雄性特异表达的miRNA-mRNA 481对。通过互作网络和功能富集分析，检测到4个与雌、雄白纹伊蚊性别分化及生殖功能相关的mRNA，以及直接参与调控它们的17个miRNA。结论 构建了雌、雄白纹伊蚊样品中差异表达的miRNA-mRNA互作网络，筛选获得性别相关的17个miRNA和4个mRNA，为进一步验证miRNA在白纹伊蚊性别分化中的调控作用奠定基础。收起

基金

国家自然科学基金

学科

【教育部学科】医学

文献类型

期刊

浏览量

60