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作者

王运娇 吕梦 蔡莎莎

作者单位

山东第一医科大学(山东省医学科学院)研究生院

刊名

安徽医科大学学报

年份

2023

卷号

第58卷

期号

第5期

页码

711-717

ISSN

1000-1492

关键词

扎那纹胸鮡 g型溶菌酶 生物信息学分析 组织表达谱

分类号

Q78

摘要

目的 鉴定扎那纹胸鮡g型溶菌酶编码序列，分析其在宿主免疫系统中的作用。方法 通过巢氏PCR技术克隆了GzLysG cDNA序列，通过ExPASy、SignalP 5.0、CDD、Clustal Omega等在线软件对GzLysG蛋白进行生物信息学分析，利用RT-qPCR技术分析了GzLysG mRNA在不同组织中的表达情况。结果 GzLysG cDNA的开放阅读框全长558 bp,编码185个氨基酸，其蛋白序列分子量为20 478.20 u,理论等电点为9.16,是一种稳定的碱性亲水性蛋白质。该蛋白无信号肽，含有g型溶菌酶典型的催化活性位点、GEWL结构域和SLT结构域。高级结构分析发现，GzLysG蛋白以α螺旋和无规则卷曲结构为主，其分子表面有一条与溶菌酶活性密切相关的狭长裂缝。系统进化分析表明溶菌酶在物种进化过程中较为保守，且GzLysG与斑马鱼来源的溶菌酶表现出较近的亲缘关系。组织表达谱分析发现，GzLysG mRNA在免疫保护相关的皮肤、肌肉和鳃组织中具有较高表达量。结论 GzLysG在扎那纹胸鮡固有免疫防御中可能发挥重要作用。

基金

国家自然科学基金

文献类型

期刊

浏览量

17