基于孟德尔随机化及生物信息学方法探究桥本甲状腺炎与缺血性脑卒中的关系及关键基因筛选
- 作者单位
- 2山东第二医科大学麻醉学院 1山东第一医科大学附属中心医院心内科
- 刊名
- 现代预防医学
- 年份
- 2025
- 卷号
- 第52卷
- 期号
- 第6期
- 页码
- 994-1000
- ISSN
- 1003-8507
- 分类号
- R581.4;R743.3
- 摘要
- 目的 利用孟德尔随机化方法探讨桥本甲状腺炎与缺血性脑卒中的因果关系,应用生物信息学方法筛选两疾病的关键共病基因。方法 选择与暴露因素显著相关的单核苷酸多态性为工具变量。随机效应逆方差加权法为MR分析的主要方法,比值比评价因果关联。在GEO数据库下载HT与IS基因芯片数据集,对HT数据进行WGCNA及差异分析并与IS的差异基因取交集筛选两疾病重叠基因。Cytoscape软件cytoHubba包5种算法排名前20的基因相交得到Hub基因,LASSO回归进一步筛选关键共病基因。结果 IVW结果表明,HT是IS发病的危险因素;IS未增加HT的发病风险。将HT与IS的GEO数据整合分析,获得102个重叠基因。5种算法获得11个Hub基因,LASSO回归确定SERBP...
- 基金 山东省自然科学基金
- 文献类型
- 期刊
- 浏览量
- 3
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