iTRAQ-SCX-LC-MS/MS技术分析胶质母细胞瘤蛋白质组的重复性研究
- 作者单位
- 2中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院 湖南省肿瘤医院肺胃肠内科, 长沙 1山东第一医科大学药学院 山东省医药卫生卵巢癌多组学重点实验室 济南市肿瘤多组学重点实验室, 济南 3中南大学湘雅医院神经外科, 长沙
- 刊名
- 中国医师杂志
- 年份
- 2026
- 卷号
- 第28卷
- 期号
- 第1期
- ISSN
- 1008-1372
- 分类号
- R739.41
- 摘要
- 目的探讨相对和绝对定量同位素标记-强离子交换柱-液相色谱-串联质谱技术分析胶质母细胞瘤蛋白质组的重复性, 以获得胶质母细胞瘤可靠的蛋白质组改变谱。方法从胶质母细胞瘤组织中提取蛋白质、进行十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳法验证并进行胰酶酶解后, 用6-plex iTRAQ对肽段样品进行标记, 进行4次平行重复实验, 运用SCX高效液相色谱技术将样品分离为30个组分, 每个组分进行LC-MS/MS分析, 之后运用ProteinPilot软件对质谱数据进行数据库搜索。结果 SDS-PAGE结果显示条带清晰, 保证此次实验所用蛋白质样品的质量控制良好。质谱数据校验显示鉴定的5 419个蛋白质及肽段长度符合胰酶消化规律。对4次iTRAQ标记实验结果的重复性分析结果显示:87.5%蛋白质的变异系数0.98, 98.80%的蛋白质变化倍数<3倍, 表明iTRAQ-SCX-LC-MS/MS技术用于胶质母细胞瘤蛋白质组的分析中具有良好的重复性。
- 基金 国家自然科学基金;山东省自然科学基金
- 文献类型
- 期刊
-
被引次数
-
收录
CA
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