专家学者_山东第一医科大学机构知识库
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iTRAQ-SCX-LC-MS/MS技术分析胶质母细胞瘤蛋白质组的重复性研究
作者
杨腊梅 杨海燕 邵倩雯 房政 刘莹 冯晓霞 张艳君 李学军 李娜 詹显全
作者单位
2中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院 湖南省肿瘤医院肺胃肠内科, 长沙 1山东第一医科大学药学院 山东省医药卫生卵巢癌多组学重点实验室 济南市肿瘤多组学重点实验室, 济南 3中南大学湘雅医院神经外科, 长沙
刊名
中国医师杂志
年份
2026
卷号
第28卷
期号
第1期
ISSN
1008-1372
关键词
胶质母细胞瘤 蛋白质组 等重同位素标签相对和绝对定量技术 色谱法 液相 串联质谱法
分类号
R739.41
摘要
目的探讨相对和绝对定量同位素标记-强离子交换柱-液相色谱-串联质谱技术分析胶质母细胞瘤蛋白质组的重复性, 以获得胶质母细胞瘤可靠的蛋白质组改变谱。方法从胶质母细胞瘤组织中提取蛋白质、进行十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳法验证并进行胰酶酶解后, 用6-plex iTRAQ对肽段样品进行标记, 进行4次平行重复实验, 运用SCX高效液相色谱技术将样品分离为30个组分, 每个组分进行LC-MS/MS分析, 之后运用ProteinPilot软件对质谱数据进行数据库搜索。结果 SDS-PAGE结果显示条带清晰, 保证此次实验所用蛋白质样品的质量控制良好。质谱数据校验显示鉴定的5 419个蛋白质及肽段长度符合胰酶消化规律。对4次iTRAQ标记实验结果的重复性分析结果显示:87.5%蛋白质的变异系数0.98, 98.80%的蛋白质变化倍数<3倍, 表明iTRAQ-SCX-LC-MS/MS技术用于胶质母细胞瘤蛋白质组的分析中具有良好的重复性。
基金
国家自然科学基金;山东省自然科学基金
文献类型
期刊
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