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作者

李仙仙 鲁艳芹 韩金祥

作者单位

山东第一医科大学第一附属医院内分泌科 山东第一医科大学(山东省医学科学院)生物医学科学学院

刊名

罕少疾病杂志

年份

2022

卷号

第29卷

期号

第1期

页码

85-88

ISSN

1009-3257

关键词

COL1A2 hsa＿circ＿0008957 快速克隆 生物信息学预测

分类号

Q78

摘要

目的构建Ⅰ型胶原蛋白结构基因COL1A2的靶向circRNA hsa circ 0008957其靶向miRNA的功能。方法采用circbase软件,获取hsa c irc 0 008957序列,采用PCR进行circRNA克隆,通过同源重组接入circRNA表达载体pCD2.1。重组载体pCD2.1-hCOL1A2 c irc 0 008957通过PCR、双酶切、Sanger测序进行验证。利用circBANK,circinteractome网站进行hsa c irc 0 008957靶miRNA及其功能预测。结果 pCD2.1-hCOL1A2-circ-0008957重组载体构建成功。Hsa c irc 0 008957预测出该circRNA不具有蛋白编码功能,其靶miRNA hsa m iR 1 305,hsa m iR 1 40-3p,hsa m iR 4 21,hsa m iR 5 48c 3 p和hsa m iR 6 28-3p与成骨相关,预测hsa c irc 0 008957可能通过这些miRNA参与成骨分化。结论 Hsa c irc 0 008957通过miR-1305、...更多

目的构建Ⅰ型胶原蛋白结构基因COL1A2的靶向circRNA hsa circ 0008957其靶向miRNA的功能。方法采用circbase软件,获取hsa c irc 0 008957序列,采用PCR进行circRNA克隆,通过同源重组接入circRNA表达载体pCD2.1。重组载体pCD2.1-hCOL1A2 c irc 0 008957通过PCR、双酶切、Sanger测序进行验证。利用circBANK,circinteractome网站进行hsa c irc 0 008957靶miRNA及其功能预测。结果 pCD2.1-hCOL1A2-circ-0008957重组载体构建成功。Hsa c irc 0 008957预测出该circRNA不具有蛋白编码功能,其靶miRNA hsa m iR 1 305,hsa m iR 1 40-3p,hsa m iR 4 21,hsa m iR 5 48c 3 p和hsa m iR 6 28-3p与成骨相关,预测hsa c irc 0 008957可能通过这些miRNA参与成骨分化。结论 Hsa c irc 0 008957通过miR-1305、miR-140-3p、miR 4 21、miR 5 48c 3 p和miR 6 28 3 p参与成骨分化,且预测COL1A2靶向miRNA与17种miRNA取交集,得出hsa m iR 6 18,该miRNA与肿瘤疾病相关,为后续在细胞水平上进一步验证hsa c irc 0 008957的调节功能奠定了基础。收起

文献类型

期刊

浏览量

45