长爪沙鼠中新型星状病毒和副粘病毒的鉴定

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作者单位: 山东第一医科大学基础医学院病原生物学系山东第一医科大学附属省立医院陕西省疾病预防控制中心山东第一医科大学公共卫生学院山东第一医科大学新发传染病病因流行病学重点实验室

摘要: 长爪沙鼠是鼠科的小型啮齿类动物，广泛分布于中国北方的荒漠草原地区，但很少有在野生长爪沙鼠中发现病毒的报道。利用宏转录组测序技术，课题组从陕西省鼠疫疫区的长爪沙鼠中发现了两种新型RNA病毒，分别命名为Gerbil astrovirus 和Gerbil paramyxovirus 。基于ORF1a、RdRp和ORF2氨基酸序列的系统发育分析表明，GeAstV与啮齿类和猪相关星状病毒关系最为密切，其中RdRp与猪星状病毒的氨基酸序列同源性最高，为75.07%，而ORF1a和ORF2蛋白与一种啮齿类星状病毒同源性分别为42.14%和35.94%，提示可能存在重组和潜在的跨物种传播事件。对于新发现的GePV，进化分析表明与Tailam virus和Beilong virus关系密切，其中L蛋白与Jeilongvirus属7种病毒的同源性为61%-77%。值得注意的是，GeAstV仅在肺标本中检测到，GePV仅在肾标本中检测到。总之，该研究证明了两种新的沙鼠RNA病毒的存在，加深了人们对野生长爪沙鼠携带病毒多样性的认识。

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