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作者

吴云姣 林小娟 张晓 刘少楠 徐爱强 陶泽新 刘桂芳

作者单位

¹山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院 ²山东省疾病预防控制中心

刊名

病毒学报

年份

2023

卷号

第39卷

期号

第5期

页码

1336-1342

ISSN

1000-8721

关键词

Kadipiro病毒 分离 下一代测序 全基因组测序 系统发生

分类号

R373

摘要

对2021年采集自山东省微山县蚊虫中的Kadipiro病毒进行分离鉴定和全基因组序列特征分析。将蚊虫标本研磨处理后接种细胞进行病毒分离，应用下一代测序技术对病毒分离物的全基因组序列进行测定，使用BioEdit 7.0.5.3软件进行相似性比较，使用Mega 11.0软件进行系统发生分析。成功分离到4株KDV，分别命名为SD21264、SD21397、SD21398和SD21399，均分离自三带喙库蚊。该4株KDV均能引起C6/36细胞产生明显的细胞病变，表现为细胞圆缩、间隙变大，但不能引起BHK21细胞病变。核苷酸相似性分析显示山东株中除了第7节段和第11节段之外，其他各节段互相之间的一致性大多＞98.0%；与GenBank已有的4个KDV基因组序列相比，本研究分离株与我国2013年分离株和2016年分离株的核苷酸一致性较高，其中片段1、3、6、9的一致性＞98.0%；而与印尼株JKT-7075和丹麦株21164-6/M.dau/DK/2015的一致性较低，大多数片段在80%～90%之间。系统进化分析显示本研究分离株大部分节段与我国2016年分离株的进化关系最近，但7、11等部分节段有...更多

对2021年采集自山东省微山县蚊虫中的Kadipiro病毒进行分离鉴定和全基因组序列特征分析。将蚊虫标本研磨处理后接种细胞进行病毒分离，应用下一代测序技术对病毒分离物的全基因组序列进行测定，使用BioEdit 7.0.5.3软件进行相似性比较，使用Mega 11.0软件进行系统发生分析。成功分离到4株KDV，分别命名为SD21264、SD21397、SD21398和SD21399，均分离自三带喙库蚊。该4株KDV均能引起C6/36细胞产生明显的细胞病变，表现为细胞圆缩、间隙变大，但不能引起BHK21细胞病变。核苷酸相似性分析显示山东株中除了第7节段和第11节段之外，其他各节段互相之间的一致性大多＞98.0%；与GenBank已有的4个KDV基因组序列相比，本研究分离株与我国2013年分离株和2016年分离株的核苷酸一致性较高，其中片段1、3、6、9的一致性＞98.0%；而与印尼株JKT-7075和丹麦株21164-6/M.dau/DK/2015的一致性较低，大多数片段在80%～90%之间。系统进化分析显示本研究分离株大部分节段与我国2016年分离株的进化关系最近，但7、11等部分节段有基因重排发生的证据。本研究结果丰富了Kadipiro病毒的全基因组信息。应加强对该病毒的监测，探索其与人类发热或脑炎等疾病的关联。收起

学科

【教育部学科】医学

文献类型

期刊

浏览量

15