山东省蚊虫中一株猪萨佩罗病毒的基因特征分析
- 作者单位
- 山东省疾病预防控制中心免疫预防管理所 山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院
- 刊名
- 中华实验和临床病毒学杂志
- 年份
- 2024
- 卷号
- 第38卷
- 期号
- 第6期
- 页码
- 676-680
- ISSN
- 1003-9279
- 摘要
- 目的:对山东省微山县蚊虫标本中分离的一株猪萨佩罗病毒进行全基因组序列测定及基因特征分析。方法:2021年在山东省微山县猪圈中采集蚊虫标本,将采集的蚊虫标本研磨后接种C6/36和BHK21细胞进行病毒分离;对阳性分离物提取核酸,采用下一代测序技术测定全基因组序列;使用软件MEGA 7.0.26、BioEdit 7.0.9.0和Simplot 3.5.1进行系统发生、相似性和重组分析。结果:从三带喙库蚊中分离到一株病毒,经测序鉴定为PSV,命名为265/SD,能引起BHK21细胞圆缩、脱落。其全基因组序列长7 558 nt,VP1区系统发生分析显示毒株265/SD属于传统基因型,该毒株序列在VP1区和3D区系统发生树的位置不同提示有发生重组的可能性,相似性曲线分析提示了重组现象的发生,但未发现确切的重组母体。VP1区相似性分析显示本研究毒株序列与山东省2016年PSV序列的核苷酸与氨基酸相似性均较低,分别为77.3%和80.3%。结论:本研究数据丰富了山东省PSV全基因组信息,为科学防控PSV提供依据。
- 文献类型
- 期刊
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- 5
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