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作者

龙森 纪峰 林小娟 刘尧 陶泽新 徐爱强

作者单位

¹山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院 ²山东省疾病预防控制中心

刊名

病毒学报

年份

2024

卷号

第40卷

期号

第3期

页码

528-535

ISSN

1000-8721

关键词

人类札如病毒 环境监测 下一代测序 分子流行病学

分类号

R373

摘要

札如病毒具有高度的遗传多样，是引起散发或暴发病毒性胃肠炎的重要病原体之一。为了解中国东部地区人类SaV的流行情况及其基因型多样性，本研究于2020年1月至2022年12月，在山东省济南市采集并处理了36份污水样本，实时荧光定量RT-PCR检测显示33份污水样本为阳性；使用巢式RT-PCR对部分VP1序列进行扩增，电泳显示16份样本为阳性；对扩增产物分别进行下一代测序和分析，共鉴定出7种SaV基因型，属于GI、GII和GV三个基因群，包括5种主要基因型和2种不常见的基因型；研究期间内，优势基因型在2021年4月前后由GI.2型转换为GI.1型。基于部分VP1序列的系统发生学分析显示本地序列和外来序列在某些分支中聚集，具有密切的亲缘关系。本研究丰富了新冠疫情以来三年内札如病毒的分子流行病学特征，证明了基于NGS的环境污水监测可以增加人们对SaV流行状况的认识，对深入研究我国SaV的分布及流行具有重大意义。

基金

国家自然科学基金

学科

【教育部学科】医学

文献类型

期刊

浏览量

7