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作者

孙悦 何松 曾一峰 卢玉萌 曹颖 洒荣波

作者单位

²山东农业工程学院食品科学与工程学院 ³泰安市疾病预防控制中心 ¹山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院

刊名

中国微生态学杂志

年份

2023

卷号

第35卷

期号

第10期

页码

1144-1150

ISSN

1005-376X

关键词

丹参 生防细菌 群落多样性 高通量测序

分类号

S476;S435.675

摘要

目的 利用高量测序方法探究生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响。方法 向丹参植株根部施入生防细菌DS-R5，培养45 d后采集根际和根表土壤样品提取总DNA，扩增样品基因组DNA的V4―V5区后进行双端测序，利用生物信息学解析生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响。结果 菌株DS-R5处理后增加了根际和根表土壤真菌群落的多样性和丰度；根际土壤共有物种种类大于根表土壤，说明菌株DS-R5处理后根际土壤处理与对照物种种类更接近，而对根表土壤中的微生物物种影响较大。真菌群落结构组成分析结果表明，不同土壤样品在门水平上共有优势真菌主要有子囊菌门、接合菌门、担子菌门和未分类；相比根表土壤对照样品，根表土壤处理样品中子囊菌门丰度下降了13.0%，接合菌门丰度升高了69.2%；根际土壤处理样品相比根际土壤对照样品，子囊菌门和接合菌门丰度分别升高了5.9%和8.9%，但二者差异无统计学意义。在属水平上，根表土壤样品经菌株DS-R5处理后提高了有益菌属的丰度，同时降低了有害菌属的丰度。结论 丹参植株施入生防细菌后，改变了根际土壤和根表土壤中微生物群落结构和多样性，本研究结果...更多

目的 利用高量测序方法探究生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响。方法 向丹参植株根部施入生防细菌DS-R5，培养45 d后采集根际和根表土壤样品提取总DNA，扩增样品基因组DNA的V4―V5区后进行双端测序，利用生物信息学解析生防细菌对丹参植株根际和根表土壤真菌群落多样性的影响。结果 菌株DS-R5处理后增加了根际和根表土壤真菌群落的多样性和丰度；根际土壤共有物种种类大于根表土壤，说明菌株DS-R5处理后根际土壤处理与对照物种种类更接近，而对根表土壤中的微生物物种影响较大。真菌群落结构组成分析结果表明，不同土壤样品在门水平上共有优势真菌主要有子囊菌门、接合菌门、担子菌门和未分类；相比根表土壤对照样品，根表土壤处理样品中子囊菌门丰度下降了13.0%，接合菌门丰度升高了69.2%；根际土壤处理样品相比根际土壤对照样品，子囊菌门和接合菌门丰度分别升高了5.9%和8.9%，但二者差异无统计学意义。在属水平上，根表土壤样品经菌株DS-R5处理后提高了有益菌属的丰度，同时降低了有害菌属的丰度。结论 丹参植株施入生防细菌后，改变了根际土壤和根表土壤中微生物群落结构和多样性，本研究结果可以为利用生防细菌防控丹参根腐病提供理论参考。收起

基金

山东省中医药科技发展计划项目

文献类型

期刊

浏览量

17