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作者

曹梦圆 崔亚楠 王敏 姚雪 韦庆娟 胡弢 邢薇佳 史卫峰 李娟

作者单位

²山东第一医科大学(山东省医学科学院)临床与基础医学院(基础医学研究所)病原生物学系 ⁸上海交通大学医学院上海市病毒研究院 ¹山东第一医科大学(山东省医学科学院)山东省高等学校新发传染病重点实验室 ³泰安市疾病预防控制中心 ⁶泰安市妇幼保健院 ⁵济南市儿童医院 ⁷上海交通大学医学院附属瑞金医院 ⁴山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院

刊名

中国病原生物学杂志

年份

2024

卷号

第19卷

期号

第6期

页码

659-664，670

ISSN

1673-5234

关键词

柯萨奇病毒B组5型（CVB5） 手足口病 全基因组 VP1 遗传进化

分类号

R373.23

摘要

目的 探明山东11株柯萨奇病毒B组5型的全基因组特征，探讨CVB5病毒遗传进化规律。方法 采集2020年山东省手足口病患者的粪便样本，通过临床样本荧光定量检测、病毒分离、高通量和一代测序验证，共获得11株CVB5分离株，同时结合GenBank公共数据库中收录的CVB5病毒株全长基因组和结构蛋白VP1基因序列，构建最大似然系统进化树，研究CVB5基因特征和遗传进化规律。结果 11株CVB5分离株全长基因组呈高度核苷酸和氨基酸相似性,与多数2008-2020年我国流行毒株均位于全基因组进化树的Group 4分支，且与2013年江苏省分离株417核苷酸相似性最高，为96.8%;11株CVB5分离株与Group 4参考株相比，P3区3A、3B、3C和3D基因核苷酸同源性均低于P1和P2区其他基因，且多为同义突变；11株CVB5分离株VP1基因位于我国主要流行亚型即C4基因亚型中，与2018年山东省分离株SWG14、SWG44、JN18120亲缘关系较近，核苷酸同源性为96.1%～98.2%。结论 CVB5毒株在我国多地持续流行，11株山东分离株同国内多数CVB5株的全基因组及VP1基因均位于同...更多

目的 探明山东11株柯萨奇病毒B组5型的全基因组特征，探讨CVB5病毒遗传进化规律。方法 采集2020年山东省手足口病患者的粪便样本，通过临床样本荧光定量检测、病毒分离、高通量和一代测序验证，共获得11株CVB5分离株，同时结合GenBank公共数据库中收录的CVB5病毒株全长基因组和结构蛋白VP1基因序列，构建最大似然系统进化树，研究CVB5基因特征和遗传进化规律。结果 11株CVB5分离株全长基因组呈高度核苷酸和氨基酸相似性,与多数2008-2020年我国流行毒株均位于全基因组进化树的Group 4分支，且与2013年江苏省分离株417核苷酸相似性最高，为96.8%;11株CVB5分离株与Group 4参考株相比，P3区3A、3B、3C和3D基因核苷酸同源性均低于P1和P2区其他基因，且多为同义突变；11株CVB5分离株VP1基因位于我国主要流行亚型即C4基因亚型中，与2018年山东省分离株SWG14、SWG44、JN18120亲缘关系较近，核苷酸同源性为96.1%～98.2%。结论 CVB5毒株在我国多地持续流行，11株山东分离株同国内多数CVB5株的全基因组及VP1基因均位于同一进化分支，说明11株分离株均为近期国内流行株，它们所在Group 4为国内优势流行分支，C4基因亚型为国内VP1基因流行亚型。收起

基金

国家自然科学基金;山东省自然科学基金

学科

【教育部学科】医学

文献类型

期刊

浏览量

4