多耐药奇异变形杆菌的耐药基因特征及基因组溯源分析

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作者单位: ¹山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院, 济南 ³山东第一医科大学(山东省医学科学院)附属省立医院医院感染管理办公室, 济南 ²山东省疾病预防控制中心传染病防制所, 济南 ⁴济南市疾病预防控制中心中心办公室, 济南

摘要: 目的探究山东省泰安市与莱州市门诊腹泻病例来源奇异变形杆菌的耐药情况及基因组特征。方法收集2021年1月至2022年12月山东省泰安市与莱州市43家哨点医院收治的510例急性腹泻患者的510份粪便样本, 通过直接接种培养并分离获得变形杆菌, 采用微量肉汤稀释法进行药物敏感试验, 通过全基因组测序及生物信息分析获得耐药基因和毒力基因信息, 揭示blaOXA-1与blaCTX-M-65基因周围遗传环境。采用RidomSeqSphere+软件通过自定义的方式对本研究菌株与100株从美国国家生物技术信息中心数据库下载的PM分离株进行单核苷酸多态性分析与核心基因组多位点序列分型, 探究菌株间系统进化关系。结果 510份粪便样本共分离获得35株变形杆菌, 其中31株PM, 检出率为6.08%, 4株普通变形杆菌。PM的多重耐药率为100.00%。35株分离株共携带43种耐药基因类型, 13株PM携带blaOXA-1, 6株PM同时携带blaOXA-1与blaCTX-M-65基因, 15株PM至少携带15种抗生素耐药基因(AR...

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