HBV相关肝细胞癌肝组织中HBV cccDNA突变位点筛选分析
- 作者单位
- 北京大学医学部病原生物学系 泰山医学院公共卫生学院
- 刊名
- 中国病原生物学杂志
- 年份
- 2016
- 卷号
- 第3期
- 页码
- 229-233
- ISSN
- 1673-5234
- 分类号
- R512.62;R735.7
- 摘要
- 目的 阐明乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关肝细胞癌的癌组织与癌旁组织中HBV cccDNA全基因组的点突变模式及其与HBV cccDNA和总DNA含量的关系,寻找可以作为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后判断指标的突变位点。方法 取23例HCC患者术后肝癌与癌旁组织各1份,采用Qiagen法提取DNA,采用滚环扩增HBV cccDNA,采用Taqman探针法定量测定HBV cccDNA和总DNA。采用PCR分段扩增HBV cccDNA全基因组,PCR产物纯化后测序,确定其基因型,并与标准野生株序列比对,确定HBV cccDNA的突变位点。结果肝癌与癌旁组织中HBV cccDNA突变频率较高的位点集中于X和C区,肝癌与癌旁组织突变个数之和大于10的位点有26个。G1719突变组HBV cccDNA和总DNA的含量均低于T1719野生型组(t=2.449,P<0.05和t=2.525,P<0.05),G1719突变组患者术后生存时间短于T1719野生型组(χ2=8.56,P<0.05),并且T1719...更多
- 基金 山东省自然科学基金
- 学科
- 【教育部学科】医学
- 文献类型
- 期刊
- 浏览量
- 6
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