胃源性柠檬双面神菌的耐药和毒力全基因组分析
- 作者单位
- 山东第一医科大学(山东省医学科学院) 青岛大学附属青岛市市立医院中心实验室 青岛大学附属青岛市市立医院消化内科
- 刊名
- 临床医学进展
- 年份
- 2023
- 卷号
- 第3期
- ISSN
- 2161-8712
- 摘要
- 【目的】从基因组水平上探讨胃源性柠檬双面神菌PA32株的耐药性和致病机制。【方法】采用耐酸实验测定PA32菌株的耐酸能力,采用纸片扩散法测定PA32菌株对4种抗菌药物的敏感性,利用三代测序平台对其进行全基因组测序和组装,利用glimmer进行基因预测,利用VFDB数据库、CARD数据库进行毒力和耐药基因功能注释。【结果】耐酸实验表明,PA32菌株能够耐受pH 2的酸性环境。药敏实验表明,PA32菌株对甲硝唑耐药,对克拉霉素、四环素、左氧氟沙星均敏感。该菌株的基因组包括一条完整的环状染色体序列,染色体长度为3,459,946 bp,鸟嘌呤–胞嘧啶含量为73.1%,编码3296个基因。PA32菌株含有黏附和侵袭、分泌系统和无氧呼吸相关毒力基因,以及对氟喹诺酮类、氨基糖苷类、四环素类、大环内酯类、β-内酰胺类等多种抗生素的耐药基因。【结论】胃源性柠檬双面神菌耐酸能力强,从基因组学水平分析具备致病潜力,这与其携带的多种毒力基因和耐药基因相关。
- 基金 国家自然科学基金
- 文献类型
- 期刊
- 浏览量
- 20
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