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作者

李志鹏 王莉莉 张庆龙 董全江

作者单位

山东第一医科大学(山东省医学科学院) 青岛大学附属青岛市市立医院中心实验室 青岛大学附属青岛市市立医院消化内科

刊名

临床医学进展

年份

2023

卷号

第3期

ISSN

2161-8712

关键词

柠檬双面神菌 全基因组 耐药性 毒力

摘要

【目的】从基因组水平上探讨胃源性柠檬双面神菌PA32株的耐药性和致病机制。【方法】采用耐酸实验测定PA32菌株的耐酸能力，采用纸片扩散法测定PA32菌株对4种抗菌药物的敏感性，利用三代测序平台对其进行全基因组测序和组装，利用glimmer进行基因预测，利用VFDB数据库、CARD数据库进行毒力和耐药基因功能注释。【结果】耐酸实验表明，PA32菌株能够耐受pH 2的酸性环境。药敏实验表明，PA32菌株对甲硝唑耐药，对克拉霉素、四环素、左氧氟沙星均敏感。该菌株的基因组包括一条完整的环状染色体序列，染色体长度为3,459,946 bp，鸟嘌呤–胞嘧啶含量为73.1%，编码3296个基因。PA32菌株含有黏附和侵袭、分泌系统和无氧呼吸相关毒力基因，以及对氟喹诺酮类、氨基糖苷类、四环素类、大环内酯类、β-内酰胺类等多种抗生素的耐药基因。【结论】胃源性柠檬双面神菌耐酸能力强，从基因组学水平分析具备致病潜力，这与其携带的多种毒力基因和耐药基因相关。

基金

国家自然科学基金

文献类型

期刊

浏览量

21