白花丹参顺式还原酮加双氧酶基因的克隆、分子特征和表达调控分析
- 作者单位
- 泰山医学院生物科学系
- 刊名
- 中国中药杂志
- 年份
- 2011
- 卷号
- 第3期
- 页码
- 346-350
- ISSN
- 1001-5302
- 关键词
- 白花丹参 顺式还原酮加双氧酶(ARD)基因 序列分析 表达分析
- 分类号
- S567.53
- 摘要
- 目的:获得白花丹参参与乙烯和多胺合成的顺式还原酮加双氧酶(acireductone dioxygenase,ARD)基因(命名为SmARD)序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:利用全长cDNA文库技术,从两年生白花丹参根中获得目的基因SmARD序列。利用BLAST进行序列比对,ORF Finder寻找该基因的开放读码框,prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在白花丹参幼苗根、茎、叶和成花中的表达情况。结果:得到688 bp的SmARD基因全长序列。具有一个591 bp的开放读码框,编码196个氨基酸,预测蛋白质相对分子质量23.27 kDa。使用预测的SmARD蛋白序列在NCBI中进行蛋白保守域分析,发现SmARD与ARD/ARD′家族具有很高的同源性。半定量RT-PCR表明,SmARD在白花丹参幼苗根、茎、叶和成花等组织中均有转录水平的表达,但是在根部表达最强。水分亏缺处理3 d,150 mmol.L-1NaCl处理1 d,4℃低温处理1 d和100μmol.L-1ABA处理1 d均抑制SmARD的表达,100μmol.L-1茉莉酸甲脂(M...更多
- 基金 山东省中医药科技发展计划项目;山东省自然科学基金
- 学科
- 【教育部学科】农学
- 文献类型
- 期刊
- 浏览量
- 55
-
被引次数
超星被引:4;
-
收录
CSCD
核
CA
统计源
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