小鼠Reelin基因启动子克隆鉴定及生物信息学分析
- 作者单位
- 泰山医学院附属医院神经内科 包头医学院生物医学研究中心 丽水学院医学院 包头医学院基础医学院 鄂尔多斯市康巴什新区医疗急救中心
- 刊名
- 泰山医学院学报
- 年份
- 2012
- 卷号
- 第7期
- 页码
- 484-487
- ISSN
- 1004-7115
- 分类号
- R346
- 摘要
- 目的克隆小鼠Reelin基因启动子区并分析其潜在DNA甲基化位点和转录因子结合位点。方法根据NCBI上小鼠Reelin 5’非翻译区序列设计引物,利用高保真PCR方法克隆昆明小鼠Reelin启动子区序列,并进行TA克隆,测序鉴定。利用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,通过PCR技术和测序技术对Reelin启动子-636 bp至-135bp序列甲基化情况分析。应用Methyl Primer Express software V1.0和TFSEARCH软件分析该区域甲基化位点和转录因子结合位点。结果成功克隆了小鼠Reelin基因启动子区0至-450片段。甲基化测序分析小鼠Reelin启动子区-636 bp至-135 bp序列没有CpG二核苷酸被甲基化。小鼠Reelin翻译起始点0至-450片段利用CpG岛序列分析软件分析显示,该区域C+G含量高达78.71%,CpG含量为14.44%。该区域有120多个潜在转录因子结合位点。结论在小鼠Reelin基因启动子区0～-450发现有一个CpG岛和多个转录因子结合位点,该区域可能在小鼠Reelin基因表达调控起重要作用。
- 基金 国家自然科学基金;山东省自然科学基金;内蒙古自然科学基金
- 学科
- 【教育部学科】医学
- 文献类型
- 期刊
- 浏览量
- 41
-
被引次数
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